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    NEB//E6627S/24 reactions
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    NEB//E6627S/24 reactions

    價格: ￥21600.00 市場價: 36000.00
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    貨號: E6627S-24reactions
    品牌: NEB
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      • Description:

        Sample

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        TheNEBNextDirectBRCA1/BRCA2PanelenrichesthecompleteexoncontentofBRCA1andBRCA2genesfornext-generationse-quencinganalysis.NEBNextDirectemploysauniquehybridization-basedenrichmentworkflowthathybridizesbaitsdirectlytogenomicDNA,withouttheneedforupfrontlibrarypreparation.TheBRCA1/BRCA2paneldemonstratesextremelyhighspecificityandunmatchedcoverageuniformityacrossawiderangeofDNAinputs,allowinghighlysensitivecallingofgermlineandsomaticvariantswhilemaximizingsequencerefficiency.

        Benefits:

        • Generatefull(100%)coverageofallproteincodingregionsinBRCA1andBRCA2genes
        • Obtainhighlyuniformsequencingacrossexontargets-100%ofbasepairsinpanelhavecoveragegreaterthan20%ofthemeantargetcoverage.
        • Maximizeefficiencywitha1-dayworkflowthatcombineshighlyspecificenrichmentwithlibrarypreparation
        • ProducehighdepthsoftargetcoverageacrossawiderangeofDNAinputamountsforgermlineandsomaticvariantcalling.

        Figure1.NEBNextDirectWorkflow.
        fast hybridization workflow

        TheNEBNextDirectBRCA1/BRCA2PaneldelivershighlyefficientenrichmentofBRCA1andBRCA2codingregionswithahighpercentageofreadsmappingtotargets
        Thishistogramshowsthepercentofreadsalignedtothehumangenome,andthepercentofreadsmappedtothetargetsincludedintheBRCA1/BRCA2PanelacrossdifferentinputDNAamounts.10ng,100ngand1μgofpurifiedgenomicDNAwasenrichedusingtheNEBNextDirectBRCA1/BRCA2Panel.Sequencingreadsweregeneratedonanllumina?MiSeq?with2x75bpreads,8bpSampleIDand12bpuniquemolecularidentifier.SequencingreadalignmentswereperformedwithBWA-MEM,andPCRduplicateswerefilteredusingtheUMIs.


        TheNEBNextDirectBRCA1/BRCA2Panelproduceshighlyuniformcoverageacrosstargetregions,maximizingsequencerefficiency
        Thishistogramshowsthenormalizedmeancoverageacrosseachofthe49exontargetsoftheBRCA1andBRCA2genes.50ngofDNAwasenrichedusingthe17kbNEBNextDirectBRCA1/BRCA2Panel.SequencingreadsweregeneratedonanIlluminaMiSeqwith2x75bpreads,an8bpsampleIDand12bpuniquemolecularidentifier.SequencingreadalignmentswereperformedwithBWA-MEM,andPCRduplicateswerefilteredusingtheUMIs.


        TheNEBNextDirectBRCA1/BRCA2PanelcanbeusedtoprovidedepthsofsequencingcompatIBLewithbothgermlineandsomaticvariantcalling
        Thisfiguredemonstratesde-duplicatedcoverageofBRCA1andBRCA2genesasafunctionofsequencingdepthacrossarangeofinputDNAamounts.PurifiedgenomicDNAwasenrichedusingtheNEBNextDirectBRCA1/BRCA2Panel.SequencingreadsweregeneratedonanIlluminaMiSeqwith2x75bpreads,the8bpsampleIDand12bpuniquemolecularidentifier.SequencingreadalignmentswereperformedwithBWA-MEM,andPCRduplicateswerefilteredusingtheUMIs.


        TheNEBNextDirectBRCA1/BRCA2Panelproducesevendepthsofcoverageacrosstargetregions

        IntegrativeGenomeViewer(IGV)plotshowingthereadcoverageacrossexon1oftheBRCA1gene.50ngofDNAwasenrichedusingthe17kbNEBNextDirectBRCA1/BRCA2Panel.SequencingreadsweregeneratedonanIlluminaMiSeqwith2x75bpreads,an8bpsampleID,and12bpuniquemolecularidentifier.SequencingreadalignmentswereperformedwithBWA-MEM,andPCRduplicateswerefilteredusingtheUMIs.

        KitComponents

        Thefollowingreagentsaresuppliedwiththisproduct:

        Storeat(°C)Concentration
        NEBNextDirect?HybridizationAdditive-20
        NEBNextDirect?3′BluntingEnzymeMix-20
        NEBNextDirect?dA-TailingEnzyme-20
        NEBNextDirect?3′Adaptor-20
        NEBNextDirect?Ligase-20
        NEBNextDirect?5′BluntingEnzymeMix-20
        NEBNextDirect?5′UMIAdaptor-20
        NEBNextDirect?CleavingEnzymeMix-20
        NEBNextDirect?FFPEPhosphorylationEnzyme-20
        NEBNextDirect?BeadWash125
        NEBNextSamplePurificationBeads25
        NEBNextDirect?StreptavidinBeads4
        NEBNextDirect?HybridizationWash(HW)4
        NEBNextDirect?BeadPrepBuffer4
        NEBNextDirect?HybridizationBuffer4
        NEBNextDirect?dA-TailingBuffer4
        NEBNextDirect?AdaptorLigationBuffer4
        NEBNextDirect?5′BluntingBuffer4
        NEBNextDirect?CleavingBuffer4
        NEBNextDirect?BeadWash24
        NEBNextDirect?Q5MasterMix-20
        NEBNextDirectBRCA1/BRCA2Baits-20
      售后保障
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